当今世界上最了解agi系统的人之一，赤木律子很快就稳定了局势。
但就在众人刚松了一口气的时候……
主屏幕上，联合国秘书长的面孔被强行切入，他的表情冷硬如铁，宣读着一份不容置喙的通牒。
“……nerv总司令碇源堂，涉嫌隐瞒情报，意图利用eva引发第三次冲击，毁灭现有世界秩序，建立其个人独裁统治。
现联合国安全理事会一致决定，要求nerv立刻解除所有武装，放弃抵抗，接受全面调查！”
这番话如同一记重锤，狠狠砸在葛城美里的心上。
她瞬间明白了，这是seele的手段。恶人先告状！
对于那个隐藏在世界权力顶端，成员遍布各国政要的神秘组织而言，颠倒黑白，将nerv塑造成全人类的公敌，简直易如反掌。
可……为什么？
葛城美里的脑中闪过一丝强烈的违和感。
seele的目标是人类补完，为此他们需要使徒全部被消灭，然后利用初号机或者莉莉丝以及朗基努斯之枪来完成仪式。
可现在，最后的使徒明明还没有出现，他们为什么要在这种关键时刻掀桌子？
而且……从袭击开始到现在，碇司令和冬月副司令的人呢？指挥室里，竟然看不到他们的身影！
“警报！检测到高能量反应！在中央大垂直沟！是eva！”
一名操作员的惊呼打断了她的思绪。
大屏幕上的画面瞬间切换，鲜红的eva二号机，正以惊人的速度突破层层防御，如一颗陨石般向着地下最深处的终极教条区坠去！
“识别信号……patternbe！是使徒！”
什么？！
看到屏幕中，站在二号机肩膀上的渚薰，葛城美里的瞳孔骤然收缩。
那个叫渚薰的少年……那个seele送进来的第四适格者……他就是最后的使徒？！
这一切，从一开始就是seele布下的局？
可这说不通！seele难道想主动将人类补完计划的主导权，拱手让给一个使徒吗？
混乱的思绪还未理清，更加绝望的景象出现了。
屏幕外的巨大舷窗上，倒映出数个白色的影子。
它们如同折翼的天使，又像是来自地狱的秃鹫，缓缓从天而降，降落在第三新东京市的废墟之上。
一共九台，正是在剧场版中出现的量产型